Infeksi jamur sering timbul dari ketidakseimbangan sederhana mikroorganisme yang secara alami ada di dalam tubuh.

Hal ini sebenarnya dijajah oleh banyak jamur dan bakteri bervariasi, sebagian besar waktu tidak berbahaya dan bahkan penting untuk berfungsinya tubuh.

Namun, mungkin saja beberapa jamur ini berkembang biak dan menjadi patogen, atau jamur "eksternal", yang ditularkan misalnya oleh hewan, menyebabkan infeksi. Sebanyak 200-400 spesies jamur dapat menyebabkan penyakit pada manusia⁵.

Namun, jamur yang ada di lingkungan juga dapat mencemari manusia, misalnya:

• dengan inokulasi, selama cedera misalnya (menyebabkan sporotrichosis atau chromomycosis, dll.);
• dengan menghirup jamur (histoplasmosis, apergillosis, dll.);
• melalui kontak dengan orang yang terinfeksi (kandidiasis, kurap, dll.);
• melalui kontak dengan hewan yang terinfeksi.